Banques d'ADN ouvertes pour collaboration de recherche
DNA banks available for research collaborations

1) Titre :
Pharmacogénétique de l’acenocoumarol

Résumé: 274 sujets volontaires sains ont reçu une dose unique d’acénocoumarol (4mg). La pharmacocinétique et la pharmacodynamique ont été mesurées (concentrations plasmatiques , INR, Facteur VII)24 h après la prise du médicament.
Responsable : Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation: Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : sujets volontaires sains
Effectif: 274
Génotypes effectués : CYP2C9*1/*2/*3, séquençage du promoteur CYP2C9, séquençage du gène VKORC1 et 2000 bases du promoteur, ABCB1 (C3435T, G2677TA), SLC21A6, ABCC2, CYP2D6, Facteur II
Phénotype caractérisé : PK et PD de l’acenocoumarol (Sintrom®). Origine ethnique
Etat de la collection : terminé
Accessibilité : accès ouvert à d’autres chercheurs pour collaborations scientifiques, après accord du responsable
Déclaration CNIL : Oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Accord CPP : oui
Accord AFSSAPS: oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : INSERM
Financement : INSERM
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique
Publications :
  1. Assesment of CYP2D6 and CYP2C19 activity in vivo in man : a “cocktail” study using dextromethorphan and proguanil, alone and in combination. Clin Pharmacol Ther 66; 582-588: 1999.
  2. Pharmacogenetics of acenocoumarol pharmacodynamics.. Clin. Phamacol. Ther. 2004; 75 : 403-414
  3. Digoxin Pharmacokinetics and MDR1 genetic polymorphisms. Eur J Clin Pharmacol 2003 ; 58 : 809-812.
  4. Rapid and robust genotyping strategy for cytochrome P450 2C9 and mdr1 single nucleotide polymorphisms identification. Ann Biol Clin 2003;61:305-9..
  5. Frequency of cytochrome P450 2C9 allelic variants in the Chinese and French populations. Fundam Clin Pharmacol 2003 ; 17 :373-376.
  6. Effect of grapefruit juice on digoxin pharmacokinetics in man Clin Pharmacol Ther 2001, 70:311-6.
  7. Is Diclofenac a valuable CYP2C9 probe in human ? Eur J Clin Pharmacol 2001 ; 56 : 793-797.
  8. Influence of fluvoxamine a CYP1A2 inhibitor on tacrine pharmacokinetics in healthy volunteers. Clin. Pharmacol. Ther 1997 ; 61 : 619-627.
  9. Genetic polymorphism of Vitamin K epoxide reductase (VKORC1) 1173C>T in a Chinese and a Caucasian population. CLarramendy-Gozalo, JQ Yang, C Verstuyft, L Bodin, L Dubert, Y Zhang, C Xu, L Fan, P Jaillon, L Becquemont. Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology. 2006

2) Titre : Facteurs de risques génétiques et  environnementaux de surdosages en AVK

Résumé: étude prospective cas-témoins. 75 surdosages en AVK, 75 contrôles appariés sur la molécule prescrite, la dose et l’age
Responsable :  Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : patients hospitalisés
Effectif: 150
Génotypes effectués : CYP2C9, VKORC1
Phénotype caractérisé : INR, médicaments associés, régime, creat, ALAT, poids age sexe, ethnie
Etat de la collection : terminée
Accessibilité : accès ouvert à d’autres chercheurs pour collaborations scientifiques, après accord du responsable
Déclaration CNIL : Oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : sans
Financement : universitaire, hors appel d’offre
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique 24h/24h.
Publications :
  1. Early acenocoumarol overanticoagulation among cytochrome P450 2C9 poor metabolisers. C Verstuyft, S Morin, A Robert, M A Loriot, P Beaune, P Jaillon, L. Becquemont. Pharmacogenetics  2001 Nov;11:735-7
  2. Genetic and Environmental risk factors for oral anticoagulant overdose. . C Verstuyft, A. Robert, S. Morin, MA. Loriot, A. Flahault, P. Beaune, C. Funck-Brentano, P. Jaillon , L. Becquemont. Eur J Clin Pharmacol 2003 ; 58 : 739-745
  3. Vitamin K epoxide reductase (VKORC1) genetic polymorphism is associated to oral anticoagulant overdose. Quteineh L, Verstuyft C, Descot C, Dubert L, Robert A, Jaillon P, Becquemont L. Thromb Haemost. 2005;94:690-691.



3) Titre : Pharmacogénétique de la morphine en post op chirugie digestive (« Morphigene »)
Résumé: étude prospective observationelle chez 74 patients ayant eu une chirurgie digestive. Objectif comparer les facteur environnementaux et génétiques prédictifs des EI et de la dose consommé de morphine dans les 24 premières heurs post op
Responsable :  Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Dr Marc Beaussier, Anesthésie CHU Saint Antoine
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : patients hospitalisés
Effectif: 74
Génotypes effectués : UGT2B7, MOR1 (récepteur opioide m A118G), MDR1 (C3435T, G2677TA)
Phénotype caractérisé : TP, medicaments associés, creat, ALAT, poids age sexe, ethnie, effets indésirables de la morphine et dose de morphine sur 24 et 48h post op et dose de titration morphinique
Etat de la collection : terminée
Accessibilité : accès ouvert à d’autres chercheurs pour collaborations scientifiques, après accord des responsables
Déclaration CNIL : Oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : sans
Financement : universitaire, hors appel d’offre
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique 24h/24h.
Publications :
  1. Environmental and genetic factors associated to morphine response in postoperative period. L Coulbault, M Beaussier, C Verstuyft, H Weickmans, L Dubert, D Trégouet, C Descot, Y Parc, A Lienhart, P Jaillon, L Becquemont. Clin. Phamacol. Ther. 2006; 79: 316-24.

4) Titre : facteurs génétiques pronostiques en transplantation rénale (« Trangene »).

Résumé: cohorte prospective monocentrique observationnelle de patients transplantés rénaux. Objectif :préciser les facteurs génétiques prédictifs de rejet aigu et de survie au long cours des greffons en association avec les facteurs clinicobiologiques déjà connus.
Responsable :  Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre : Pr Antoine Durrbach, Néphrologie CHU Paris-Sud
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : patients transplantés rénaux depuis au moins 1 an, en ambulatoire
Effectif: 370
Génotypes effectués :  plus de 100 SNP pratiqués (DME&T, cytokines)
Phénotype caractérisé : rejet aigu histologiquement prouvé, survie au long cours des greffons, poids age sexe, ethnie, tous les fct du donneurs et receveur avant la greffe, traitements au cours du temps
Etat de la collection : terminée
Accessibilité : accès ouvert à d’autres chercheurs pour collaborations scientifiques, après accord des responsables
Déclaration CNIL : Oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : sans
Financement : universitaire, BQR
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique 24h/24h.
Publications :
  • 1)Influence of CYP3A5 genetic polymorphism on tacrolimus daily dose requirements and acute rejection in renal graft recipients. Quteineh L, Verstuyft C, Furlan V, Durrbach A, Letierce A, Ferlicot S, Taburet
    AM, Charpentier B, Becquemont L. Basic Clin Pharmacol Toxicol. 2008 Dec;103(6):546-52.
  • 2) Impact of VKORC1 haplotypes on long-term graft function in kidney transplantation. Quteineh L, Verstuyft C, Durrbach A, Letierce A, Ferlicot S, Charpentier B, Becquemont L.Transplantation. 2008 Sep 27;86(6):779-83.
  • 3) Michelon H, König J, Durrbach A, Quteineh L, Verstuyft C, Furlan V, Ferlicot S, Letierce A, Charpentier B, Fromm MF, Becquemont L. SLCO1B1 genetic polymorphism influences mycophenolic acid tolerance in renal transplant recipients. Pharmacogenomics. 2010 Dec;11(12):1703-13.


5) Titre : fréquences alléliques comparées du CYP2C9 et VKORC1
Résumé: Banque d’ADN génomique de sujets Chinois de Shanghai.
Responsable :  Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : patients hospitalisés
Effectif: 400
Génotypes effectués : CYP2C9 VKORC1
Phénotype caractérisé : aucun
Etat de la collection : terminé
Accessibilité : accès limité, accord de nos collègues Chinois préalable
Déclaration CNIL : non
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : sans
Financement : universitaire,
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique 24h/24h.
Publications :
  1. Frequency of cytochrome P450 2C9 allelic variants in the Chinese and French populations. Fundam Clin Pharmacol 2003 ; 17 :373-376.
  2. Genetic polymorphism of Vitamin K epoxide reductase (VKORC1) 1173C>T in a Chinese and a Caucasian population. CLarramendy-Gozalo, JQ Yang, C Verstuyft, L Bodin, L Dubert, Y Zhang, C Xu, L Fan, P Jaillon, L Becquemont. Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology. 2006




6) Titre : Facteurs de risque génétiques d’hémorragie digestive aux AINS. (« PHDI »)

Résumé: étude prospective 200 patients hospitalisés pour hémorragie digestive haute aux AINS
Responsable :  Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : patients hospitalisés
Effectif: 200 patients
Génotypes effectués : CYP2C9, CYP2C8, COX1, UGT1A1
Phénotype caractérisé : Hémostase, dosage plasmatique des AINS, Sérologie Hélicobacter pylori, médicaments associés, statut tabac- alcool, creat, bilan hépatique,  NFS, transfusions globulaires, poids age sexe, ethnie
Etat de la collection :  terminée
Accessibilité : accès ouvert à d’autres chercheurs pour collaborations scientifiques, après accord des responsables
Déclaration CNIL : Oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : APHP
Accord CPP: oui
Accord AFSSAPS: oui
Financement : PHRC régional 2003
Sécurité : Conservation des échantillons sur 2 sites hospitaliers différents. Alarmes des congélateurs avec garde téléphonique 24h/24h.
Publications : CYP2C9*3 Loss-of-Function Allele Is Associated With Acute Upper Gastrointestinal Bleeding Related to the Use of NSAIDs Other Than Aspirin. Carbonell N, Verstuyft C, Massard J, Letierce A, Cellier C, Deforges L, Saliba F, Delchier JC, Becquemont L. Clin Pharmacol Ther 2010

 

7) Titre : Pharmacogénétique comparée de l’acenocoumarol et de la fluindione

Résumé: étude prospective randomisée en cross over chez des sujets volontaires sains recrutés en fonction de leur génotype CYP2C9*3 (12 CYP2C9*1/*1, 12 CYP2C9*1/*3) recevant successivement 2 doses successives de 4 mg d’acenocoumarol et 20 mg de fluindione.
Responsable : Pr Laurent Becquemont & Dr Céline Verstuyft , Génétique moléculaire - Pharmacogénétique hôpital Bicêtre
Matériel conservé : ADN génomique
Mode de conservation : Collection dupliquée sur 2 sites différents. Congélation à –20°C de solutions mères et d’échantillons aliquotés à 100 ng/ml et 10ng/ml.
Type de patients : sujets volontaires sains
Effectif: 24
Génotypes effectués : CYP2C9, VKORC1
Phénotype caractérisé : AUC d’INR de facteur VII et de concentration de fluindione ; bilan standard d’un sujet volontaire sain poids age sexe, ethnie
Etat de la collection : terminée
Accessibilité : accès fermé jusqu’à publication de l’étude (2009 ?)
Déclaration CNIL : Oui
déclaration clinicaltrials : oui
Formulaire de consentement écrit : oui
Promoteur : APHP
Accord CPP: oui
Accord AFSSAPS: oui
Financement : PHRC régional 2003
Publications :   A PK-PD model for predicting the impact of CYP2C9 and VKORC1 polymorphisms on fluindione and acenocoumarol during induction therapy. Céline Verstuyft, Xavier Delavenne, Alexandra Rousseau Annie Robert, Michel Tod, Bertrand Diquet, Martine Lebot, Patrice Jaillon and Laurent Becquemont. Clinical Pharmacokinetics 2012; 51(1): 41-53